La historia comienza con Desmond Miles,el protagonista del juego, que va con unos cientificos a una cueva en el bosque. Desmond entra y en el fondo de la cueva encuentra el animus, que gracias al “fruto” empieza a funcionar. Entonces, Desmond caera insconsciente al suelo y reencarnara el papel de un británico llamado Haythan debido al animus. La primera mision consiste en ir a un teatro con tu personaje británico y aprovechando que la gente esta entretenida, te debes infiltrar en uno de los palcos superiores y eliminar a una persona para conseguir un amuleto . Cuando la matas y consigues el amuleto, aparecen dos encargadas del teatro y cuando suben al palco comienzan a gritar. Entonces, es cuando debes salir del teatro y montar en tu carruaje para escapar. Cuando ocurre esto, te encargan ir a Estados Unidos ( aunque en esta epoca aun no existía hasta la revolución) porque el amuleto que conseguiste es la llave para conseguir un tesoro.
Al dia siguiente vas al barco, donde van pasando los días hasta 72. Durante tu estancia en el barco hras algunas cosas como pelear contra otros marineros, escalar el barco hasta el puesto de vigía o ayudar al capitán para que lo marineros no hagan un motín. En el día 72, subes al puesto de vigía y contemplas como estás llegando a Boston. Cuando embarcas allí, comienzas tu primera mision. Un hombre llamado Charlie Lee que te da la bienvenida y te pide que le sigas. El te enseña la ciudad y de repente sale un hombre llamado Benjamin Franklin, que está muy enfadado porque las hojas de su almanaque estan desperdigadas por todo Boston. Te pide que la busques, tu aceptas y sigues a Charlie Lee hasta una posada. Alí elaboras planes junto con Charlie y otros ayudantes( los nombres de estos están escritos en una hoja que te da el que te manda a ir hasta America).La segunda mision misión consiste en buscar a un hombre que cirujano, que lo secuestraron. En esta misión debes ir por la ciudad escuchando las conversaciones de la gente y los guardias sobre este tema. Cuando recabas informacion, debes ir hasta el puerto e infiltrarte en una de las naves y ademas defender a Charlie. Cuando entras en la nave, encuentras al cirujano y a tres guardias. Mátalos y salvars al cirujano. La tercera mision consiste en infiltrarte en el fuerte Hill y rescatar a unos esclavos. Para ello, debes robarle a los ingleses un carro con esclavos para poder infiltrarse en el fuerte. Cuando te infiltras hay tres puntos donde hay esclavos. Al lado de un rio, en elcentro de un campamente y dentro de un barco, ambos vigilados por guardias. Debes rescatar a los presos sin que percaten tu presencia. A mi el que más me ha costado a sido infiltrarme en el barco, matar a los guardias y liberar a los esclavos. El truco está en subir por uno de los costados del barco, esperar a que el guardia se asome, cogerlo y tirarlo al mar. Eso creará una distracción perfecta a los otros guardias para que puedas rescatar a los esclavos. He empezado a jugar hoy y hasta aquí me he quedado. Mañana jugare y subire la 2º parte. Si falta algún dato por favor añadidlo.
